Las tesis del Departamento de Posgrado se encuentran en la colección maestría.

Los programas académicos de maestría en la UPPue son:

• Automatización de Procesos Industriales (MIAPI)
• Diseño de Bioprocesos (MDBP)
• Enseñanza de las Ciencias (MEC)
• Sistemas y Cómputo Inteligente (MISCI)
• Gestión e Innovación Tecnológica (MGIT)