La producción académica del Departamento de Posgrado se organiza en las colecciones para artículos (de la revista Visión Politécnica) y carteles (o pósters, producidos en los Simposium anuales).

Los programas académicos de posgrado en la UPPue son:

• Maestría en Ingeniería en Automatización de Procesos Industriales (MIAPI)
• Maestría en Ingeniería en Diseño de Bioprocesos (MDBP)
• Maestría en Ingeniería en Sistemas y Cómputo Inteligente (MISCI)
• Maestría en Gestión e Innovación Tecnológica (MGIT)
• Maestría en la Enseñanza de las Ciencias (MEC)
• Especialidad en Ambientes de Aprendizaje a distancia (EAA)
• Especialidad en Educación Basada en Competencias (EBC)